พิพิธภัณฑ์พืช โรงเรียนสตรีภูเก็ต เป็นการดำเนินการหนึ่งของโรงเรียนในโครงการอนุรักษ์พันธุกรรมพืช อันเนื่องมาจากพระราชดำริ สมเด็จกนิษฐาธิราชเจ้า กรมสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารี พิพิธภัณฑ์แห่งนี้จัดเป็นแหล่งเรียนรู้เกี่ยวกับโครงการดังกล่าว และมีการจัดนิทรรศการแสดงเรื่องราวเกี่ยวกับพันธุ์พืชชนิดต่าง ๆ นอกจากนี้ยังมีการจัดแสดงเรื่องราวเกี่ยวกับจังหวัดภูเก็ต และเรื่องราวเกี่ยวกับเหตุการณ์สึนามิที่เกิดขึ้นในจังหวัดภูเก็ตอีกด้วย