พิพิธภัณฑ์แห่งนี้ตั้งขึ้นโดย ศ.เอ็ดการ์ เดวิดสัน คองดอน ผู้เข้ามาปรับปรุงการศึกษาแพทย์เมื่อ พ.ศ. 2470 ต่อมา ศ. นพ.สุดแสงวิเชียร ได้พัฒนาจนเป็นพิพิธภัณฑ์กายวิภาคศาสตร์ เปิดเป็นทาง การเมื่อ พ.ศ. 2491 ภายในพิพิธภัณฑ์มีส่วนจัดแสดงแบ่งเป็น 2 ห้อง คือ ห้องแรกแสดงสิ่งแสดงทางกายวิภาคทั่วไป ประกอบด้วย กายวิภาคของอวัยวะรับความรู้สึกพิเศษ เช่น หู ตา จมูก ลิ้น การจัดแสดงระบบประสาท ระบบหลอดเลือด การจัดแสดงการเจริญเติบโตตามอายุ ตั้งแต่ เอมบริโอขนาดเล็ก ทารกในครรภ์ขนาดต่างๆ จนถึงระยะคลอด การจัดแสดงอวัยวะตามระบบต่างๆ คือ ระบบปัสสาวะและอวัยวะสืบพันธุ์ ระบบทางเดินอาหาร ระบบทางเดินหายใจ มีการจัดแสดงร่างกายมนุษย์ตัดตามขวางตลอดตัว ห้องที่ 2 จัดแสดงเฉพาะกระดูกและข้อต่อ ประกอบด้วยการจัดแสดงกระดูกทุกชิ้นของร่างกาย รวมทั้งกะโหลกซึ่งแยกเป็นชิ้นๆ แสดงส่วนประกอบของกระดูก การแสดงข้อต่อแบบต่างๆ นอกจากนี้ยังมีการจัดแสดงโครงกระดูกของบุคคลสำคัญในวงการแพทย์อีกด้วย ภายในพิพิธภัณฑ์นี้มีสิ่งจัดแสดงที่สำคัญคือ เส้นประสาททั้งร่างกาย หลอดเลือดแดงทั้งร่างกายซึ่งเป็นผลงานระดับโลกที่หาดูได้ยาก